Im Laufe seiner Geschichte ist der Circolino Pipistrello von einem kleinen Sommerprojekt zu einer komplexen Organisation gewachsen. So wurde 2003 die ursprüngliche Genossenschaft in eine Stiftung gewandelt. Heute steht dem Team des Pipistrello ein ehrenamtlicher Stiftungsrat mit kompetenter Unterstützung zur Seite.